Кафедра «Истории Кыргызстана и Зарубежного Востока» выполняет общую миссию Бишкекского гуманитарного университета, который являясь ведущим научным-инновационным, образовательным и культурным центром в области гуманитарного образования, использует свой богатый потенциал для удовлетворения интеллектуальных, культурных и социальных запросов и потребностей личности, общества и государства, содействует устойчивому развитию Кыргызской Республики. Стратегия университета ориентирована на творческое сотрудничество преподавателей и студентов, реализацию образовательных, научных и инновационных программ, создание благоприятных условий для интеллектуального и духовного развития личности, раскрытие ее творческого потенциала, сохранение и развитие лучших традиций классического гуманитарного университетского образования и обеспечение достойного места в мировом научно-образовательном пространстве.
Наряду с общей миссией, кафедра «Истории Кыргызстана и Зарубежного Востока» реализует и специальную миссию по подготовке высококвалифицированных историко-востоковедческих кадров, востребованных на рынке труда Кыргызстана и за рубежом. Кафедра готовит специалистов со всесторонней историко-востоковедной подготовкой, адаптированных к практической, теоретико-аналитической и педагогической деятельности в условиях современных требований рынка труда.
Для выполнения данной миссии профессорско-педагогический состав кафедры осуществляет свою деятельность в соответствии с Учебным планом и требованиями Госстандарта Министерством образования и науки КР и руководствуется нормативными актами ВУЗов КР, нацеленными на улучшение качества образования.